DirektoriusValdas Jankauskas Finansinės apskaitos skyrius Informavimo, bendradarbiavimo ir veiklos analizės skyrius Personalo, teisės ir viešųjų pirkimų skyrius Administracijos sekretorė Specialistas dėl antikorupcinių veiklų Direktoriaus pavaduotojaDr. Aušra Birgelytė-Žukienė DofE skyrius Gamtinio ir ekologinio ugdymo skyrius Meninio ir kultūrinio ugdymo skyrius Neformaliojo vaikų švietimo paslaugų skyrius Pilietinio, turizmo ir etnokultūrinio ugdymo skyrius Sportinio ugdymo skyrius Sveikatos ir saugos ugdymo skyrius Direktoriaus pavaduotojaGitana Viganauskienė Broniaus Oškinio vaikų aviacijos akademija Gabių ir talentingų vaikų ugdymo skyrius Jaunojo tyrėjo laboratorija Kvalifikacijos tobulinimo skyrius Neformaliojo vaikų švietimo kokybės ir stebėsenos skyrius Techninės kūrybos ir inžinerinio ugdymo skyrius Ugdymo karjerai skyrius Direktoriaus pavaduotojas Bendrųjų reikalų ir techninio aptarnavimo skyrius Biologinės įvairovės priežiūros ūkio skyrius
